慢性结肠炎是一种病程较长的慢性疾病，且发病原因及机制并不清楚，因此治疗起来比较困难，西医对此病主要运用抗生素进行消炎止痛，抗感染治疗。慢性结肠炎的防治方法很多，选择合适的治疗方式非常关键。慢性结肠炎的防治保健是预防复发、根治肠病的关键所在。
1.避免受凉，注意饮食。本病在发作期、缓解期不能进食豆类及豆制品，麦类及面食品，以及大蒜、韭菜、卷心菜、花生、瓜子等易产气体增多的食物，使胃肠动力受到影响。柿子、石榴、苹果都含有鞣酸及果胶成分，均有收敛止泻作用，慢性结肠炎可适量食用。
2.注意饮食卫生，不吃生冷、坚硬及变质的食物，禁酒及辛辣刺激性强的调味品。
3.观察自己对各种食品的适应性，注意个体差异。如吃一些不应对肠道造成影响的食品后腹泻加重，就要立即停用。
4.可以针对不同病因，多角度进行治疗，发挥中医辨证论治的优势，因而疗效显著。由于本病具有虚实夹杂、寒热错杂的特点，调理病人的肝肾脾胃，增强人的体质。
5.平常应加强锻炼，如打太极拳，以强腰状肾，增强体质。此外注意腹部保暖。