克隆病因致病因素的多样化使病人有获得自然缓解的趋向，但自发全愈者少见。目前，医学临床治疗以解痉、止痛、止血、止泻、控制感染及手术等方法，但无论何种医疗手段都离不开营养物质的支持。因此饮食疗法就显得尤为重要，这也就要求克隆病患者对饮食的要求尤为重要。
1、少量多餐。为了减轻肠道负担、补充营养摄入量，应采取少量多餐的进食方法，但应循序渐进，切不可操之过急，以免势得其反。必要时可短期使用要素膳或肠外营养，以改善全身营养状况。
2、脂肪和膳食纤维要限制。腹泻常伴有脂肪吸收不良。脂肪又是“促泻剂”，因此膳食中脂肪量不能供给太多，一般应限制在每日40克左右。对伴有脂肪泻者，可采用含中链脂肪酸的脂肪(参看中链脂肪酸膳食)。为了避免机械性刺激，促进肠道病灶的愈合及减少排便次数，膳食纤维也应予以限制饮食以低脂肪少渣为主。
3、供给充足的热能和蛋白质。克隆病病程长，病变范围广，可伴有高热、瘘管、贫血、 腹泻等症状，各种营养素的消耗较多，因此应供给充足，以补偿其营养消耗。热能按每日每公斤体重约40千卡(0 13兆焦耳)供给约2600千卡以上，蛋白质每日每公斤体重约1 5克供给，约100克左右，其中优质蛋白质约占总蛋白质的50%，根据病人对食物消化吸收的耐受情况，采用循序渐进方式提高营养供给量。高热能高蛋白质饮食能促进疾病恢复，增强抗病能力 和减少并发症的发生。
4、维生素、无机盐的供给要满足机体需要。充足的维生素、无机盐可补偿由于腹泻、发烧 、肠瘘等原因所引起的维生素、无机盐的丢失，而且也有促进蛋白质、脂肪等营养素的代谢作用。维生素C、维生素B 12 、叶酸是造血所需的原料。维生素D能促进钙、磷的吸收 ，维生素A有保护肠粘膜的作用等，故都必需供给充足，必要时用药物片剂补充。